Mindmap --- DNA 的复制

现代分子生物学 思维导图 — DNA 的复制。

Mindmap

  • DNA 的复制
    • 复制的起点
      • 复制叉
        • 刚分开的两条模板链与未复制的双链之间的链接区
        • 复制叉以 DNA 分子上某一特定序列为起点,移动的方向和速度多种多样,但以双向等速方式为主
        • 原核生物的复制叉的移动速率要比真核生物快的多。
      • 复制子
        • 即具有一个复制起点,作为一个复制单位的 DNA
        • 细菌、病毒和线粒体的 DNA 分子都作为单个复制子完成复制的
        • 真核生物基因组可以同时在多个复制起点上进行双向复制;即他们的基因组包含多个复制子
        • 原核生物只有一个复制起始点,但复制起始点可以连续发动复制
    • 所需的条件
      • 原料
        • 底物:dNTP
        • 模板:解开成单链的 DNA 母链
        • 聚合酶:依赖 DNA 的 DNA 聚合酶;简写成 DNA-pol
        • 引物:提供 3’-OH 末端使 dNTP 可以依次聚合
        • 引物酶:以 DNA 为模板催化合成 RNA 引物
        • 其他的梅和蛋白因子
    • 基本化学反应
      • 核苷酸之间形成 3’,5’- 磷酸二酯键
    • 复制的主要方式
      • 真核生物:双向等速
      • 复制泡:两个靠的很近的复制叉之间形成的空间
      • 原核生物
        • 大肠杆菌:双向等速
        • 枯草杆菌:双向不等速
        • R6K 质粒:先单向后双向
        • ColE1 质粒:单向
      • DNA 的单向复制只在噬菌体和某些质粒中出现
    • DNA 的复制特点:
    • DNA 复制的调控
      • 大肠杆菌染色体 DNA 的复制调控
        • 复制起始不依赖于细胞分裂,复制终止则能引发细胞分裂
        • 复制调控主体要发生在起始阶段
        • dnaA-ADP 复合物
        • 非甲基化 GATC-SeqA 复合物
        • 对 dam-E.Coli 的研究表明,半甲基化的 OriC 不能发动一轮新的复制
      • ColE1 质粒 DNA 的复制调控
        • Rop 蛋白和反义 RNA 控制了起始 DNA 复制所必需的引物合成。
        • RNA1 通过氢键配对与引物 RNA 前体相互作用,阻止了 RNaseH 加工引物前体,使其不能转化为 有活性的引物而对复制起负调控作用。
        • Rop 蛋白能提高 RNA1 与引物前体的相互作用,从而加强了 RNA1 的负调控作用
      • 真核生物 DNA 复制的调控
        • 细胞生活周期水平调控:DNA 复制只发生在 S 期
        • 染色体水平调控:不同部位的复制子按一定的时间顺序在 S 期起始复制
        • 复制子水平条调控
    • 复制方式:半保留复制
      • 以亲代 DNA 分子为模板合成子代 DNA 链的过程
    • DNA 的半不连续复制:
      • 原因:两条链是反向平行;两条链的复制方向都是 5’-3’
      • 亲代两个模板链的极性不同
    • DNA 复制方式的证明:
      • 全保留复制
        • 利用 N15 标记氮源,并用 CsCl 梯度超速离心进行实验排除
      • 离散复制
        • 在以上实验得到的 DNA 进行变性处理后进行 CsCl 梯度密度超速离心。
        • 结果:发现两条分开的条带;说明一条是 15N 标记的,而仍一条链则是 14N 标记的
        • 证实了 DNA 复制是半保留复制,而非分散复制
    • 半保留复制的意义:
      • 子代 DNA 与亲代 DNA 的碱基序列一致,即子代保留子代全部的遗传信息;
      • 体现了遗传的保守性
      • 遗传的保守性是物种稳定性的分子基础,但不是绝对的
    • DNA 聚合酶的共同点
      • 都以 dNTP 为底物
      • 都需要 Mg2+ 激活
      • 聚合时必须有模板链和具有 3’-OH 末端的引物链
      • 链的延伸方向都是 5’ - 3’
DNA的复制复制的起点复制叉刚分开的两条模板链与未复制的双链之间的链接区复制叉以DNA分子上某一特定序列为起点,移动的方向和速度多种多样,但以双向等速方式为主原核生物的复制叉的移动速率要比真核生物快的多。复制子即具有一个复制起点,作为一个复制单位的DNA细菌、病毒和线粒体的DNA分子都作为单个复制子完成复制的真核生物基因组可以同时在多个复制起点上进行双向复制;即他们的基因组包含多个复制子原核生物只有一个复制起始点,但复制起始点可以连续发动复制所需的条件原料底物:dNTP模板:解开成单链的DNA母链聚合酶:依赖DNA的DNA聚合酶;简写成 DNA-pol引物:提供 3’-OH 末端使 dNTP可以依次聚合引物酶:以DNA为模板催化合成RNA引物其他的梅和蛋白因子基本化学反应核苷酸之间形成 3’,5’-磷酸二酯键复制的主要方式真核生物:双向等速复制泡:两个靠的很近的复制叉之间形成的空间原核生物大肠杆菌:双向等速枯草杆菌:双向不等速R6K质粒:先单向后双向ColE1质粒:单向DNA的单向复制只在噬菌体和某些质粒中出现DNA的复制特点:原核生物真核生物DNA复制的调控大肠杆菌染色体DNA的复制调控复制起始不依赖于细胞分裂,复制终止则能引发细胞分裂复制调控主体要发生在起始阶段dnaA-ADP复合物非甲基化GATC-SeqA复合物对dam-E.Coli的研究表明,半甲基化的OriC不能发动一轮新的复制ColE1质粒DNA的复制调控Rop蛋白和反义RNA控制了起始DNA复制所必需的引物合成。RNA1通过氢键配对与引物RNA前体相互作用,阻止了RNaseH加工引物前体,使其不能转化为 有活性的引物而对复制起负调控作用。Rop蛋白能提高RNA1与引物前体的相互作用,从而加强了RNA1的负调控作用真核生物DNA复制的调控细胞生活周期水平调控:DNA复制只发生在 S 期染色体水平调控:不同部位的复制子按一定的时间顺序在 S 期起始复制复制子水平条调控复制方式:半保留复制以亲代DNA分子为模板合成子代DNA链的过程DNA的半不连续复制:原因:两条链是反向平行;两条链的复制方向都是 5’-3’亲代两个模板链的极性不同DNA复制方式的证明:全保留复制利用N15标记氮源,并用CsCl梯度超速离心进行实验排除离散复制在以上实验得到的DNA进行变性处理后进行CsCl梯度密度超速离心。结果:发现两条分开的条带;说明一条是15N标记的,而仍一条链则是14N标记的证实了DNA复制是半保留复制,而非分散复制半保留复制的意义:子代DNA与亲代DNA的碱基序列一致,即子代保留子代全部的遗传信息;体现了遗传的保守性遗传的保守性是物种稳定性的分子基础,但不是绝对的DNA聚合酶的共同点都以 dNTP 为底物都需要 Mg2+ 激活聚合时必须有模板链和具有 3’-OH 末端的引物链链的延伸方向都是 5’ - 3’

PDF